Formati Sequenze

I Flat File sono dei semplici file di testo, molto usati nei database, che contengono (ovviamente) dati .
Un tipo di Flat File è il Formato Fasta.

FASTA Format
Presenta la riga iniziale che comincia con un “>”, a cui fa seguito un identificativo unico, seguito da una opzionale corta definizione. Le linee a seguire contengono la sequenza amminoacidica o nucleotidica
Quando si visualizzano queste sequenze con un editor di testo (Tipo OpenOffice Writer, Word, ecc) è consigliabile usare un tipo di carattere (come Courier) che dà una larghezza uguale ad ogni lettera.
Perchè?! Ecco la differenza:

Molto meglio visualizzarle con un editor di testo.

Un altro tipo di Flat File è Formato RAW, che è praticamente la sequenza del FASTA senza la prima riga iniziale.
Alcuni tool bioinformatici richiedono il Formato FASTA per le sequenze, altri il formato RAW.

EDIT: ho provveduto a modificare il titolo dell’articolo, perchè l’altro non c’azzeccava niente !